黄璠在绝望中突围，却被早已等候在外的草军诸帅伏击，几乎全军覆没。
只有十余支土团见机快，从其他地方逃了出去。
当王仙芝、黄巢骑着高头大马，无数草军将士山呼海啸：「都统万岁」
二人踏入这座混乱血气味冲天的雄城时，王仙芝并没有像其他草军将领期待的那样，立刻下令抢掠，反而是笑着对黄巢道：「黄帅，且须请你调度，约束军纪啊！」
黄巢默默点头，又是做这个恶人，不过他本身就要将鄂州作为长久的根基，所以虽然晓得这是王仙芝的权谋，但还是主动入彀。
黄巢接过斧，做的第一件事就是：「诸将听令，约束各部，严明军纪，勿要犯我法！唯刀耳！」
随后，他就令黄氏诸子弟及王仙芝的牙兵作为督查，立刻接管城中各处要地，封锁府库，并在主要街道上设立哨栅。
但有草军士兵敢趁乱烧杀抢掠、奸淫妇女者，无论职位高低，一律就地斩首，悬尸示众！
命令下达的第一个时辰，便有上百个红了眼的草军士兵，因为违纪，而被砍下了脑袋。
那血淋淋的人头，被高高地挂在城门口的木杆上，吓住了一众人等。
黄巢做的第二件事，是「惩处贪官污吏」。
他命人将鄂州府库中的官吏名册、税收帐本，尽数搬到节度使府。
随即，黄巢升堂坐衙，亲自审问那些被俘的鄂州官吏。
凡是平日里鱼肉百姓、贪赃枉法者，一经查实，立刻被拖出去，在百姓的围观下，当众斩首，家产全部抄没，充作军用。
而那些为官清廉、在百姓中颇有口碑的底层小吏，则被他好言安抚，甚至官复原职，让他们协助维持城中秩序。
黄巢做的第三件事，是「安抚北行」。
鄂州城分为南北两部分，以蛇山为界。
南城多为富商大贾、官宦府邸；而北城，则挤满了贫苦的百姓、手工业者和码头力夫。
黄巢在下达了严酷的军纪之后，却又颁布了一道截然相反的命令。
草军将士，对鄂州北城，秋毫不犯！不仅不犯，还要开仓放粮，赈济那些在围城中饥寒交迫的贫民！
一时间，鄂州城内，出现了极其诡异的一幕。
南城，哭喊震天，血流成河。
无数的富户被抄家，无数的贪官被砍头，时不时就有一队草军冲进这些宅邸，将一家老小全部斩杀，城中豪右人心惶惶。