重新编组，当时命张玉统领中军，郑亨、何寿充中军左、右副将，朱能统领左军，朱荣、李睿充左军左、右副将用的是前后左右中的五军制度，其实就是五军都督府那套。
而后来随着战争进程的加速，兵员开始了大规模换血，制度也开始了调整。
之前说过，燕军在靖难前中期取胜，依靠的就是精锐骑兵的迂回，这个由朱棣和朱高煦统帅的精锐骑兵也是有名号的，全程叫做“大纛下三千小鞑子营”，这是最初的名号，嗯，就是后来的三千营.实际上靖难之役打到中期，编制就膨胀的厉害，已经远不止三千人了，这里面一部分人就成了现在的忠义卫。
虽然说出来不太好听，但实际上由于北方胡化严重，燕军真正干长距离迂回这种刀口舔血工作的，基本都是内附和汉化的鞑官，当然了，其中也有部分燕地汉儿，但客观来讲，蒙古鞑官占多数，这也是为什么建文朝的文臣在战争中总是宣传“再一次蒙古南侵”的论调的根本原因。
不过精锐骑兵确实是蒙古人比例高，但除此之外，燕军百分之七八十还是汉人的，跟安史之乱的那个燕军性质还不太一样。
除了三千营，就是主力五军营，以及负责斥候的哨马营。
建文四年燕军进入南京，论靖难战功时，就把燕军分成了五军营、三千营、哨马营、守城及其他杂类，三大营算是初见端倪了。
至于三大营的变革，在姜星火前世，朱棣第一次北征的时候，是用的三千营、哨马营和五军哨掖的体制，与靖难体制基本一致，算是完全承袭，只不过把五军营的改成了更利于指挥的中军、哨、掖；到了第二次北征的时候，就复杂了一些，全军分为随驾三千营、神机铳手、大旗大营马队并哨马官军、围子手、幼官幼军与旗鼓手、五军马步官军、传令营、舍人以及其他后勤、配属官军，编制很庞杂，而柳升带领的神机铳手，正是在第二次北征的忽兰忽失温之战中大放异彩，才给了后来神机营单独成立制造了机会；第三次北征则是记载的清楚，“时营阵，大营居中，营外分驻五军，连左哨、右哨、左掖、右掖以总之。步军居内，骑卒居外，神机营在骑卒之外，神机营外有长围，各周二十里”，正式有了神机营、五军营、三千营这三大营。
果然，既然有姜星火这个穿越者，那就不用这么慢慢摸索了，这次算是一步到位了。
“京营，设三千营、五军营、神机营为三大营。”
“第一版制度，三千营编制员额四个卫，神机营编制员额两个卫，五军营编