到医学院，在把各种医疗器械装上车的同时，趁机把装有將军头颅的两个玻璃瓶装上车，运出了医学院。
只是他们刚刚离开医学院，军统特务就赶到了。
为了带走將军的头颅，四名战士留下来狙击追捕。他们在打死十多名特务后，最终全部牺牲。
刘亚光和两名战士带著將军的头颅，成功回到了安全据点。
画面切换，出现的银幕中的是枪毙叛徒的场景，赵廷喜1946年被东北民主联军在杨靖宇將军坟前枪决；1951年，改名换姓在军区后勤部门任职的程斌被人举报后，被执行枪决。
紧接著，时间来到了1958年2月23日，杨靖宇將军的安葬仪式上，工作人员用石膏做了个模型，把將军的头颅和下半身的骨头拼在了一起，然后给遗体盖上了五星红旗，放进了一个全新的黑漆棺材里，安置在烈士陵园的灵堂。
一群参加安葬仪式的学生，神情肃穆，怀著对先烈的无尽崇敬，喊出了那句属於抗联的口號“抗联从此过，子孙不断头”，然后是一组空镜头，是现在的东北，是现在的神州大地，这些镜头就像杨靖宇將军的眼睛，深情俯瞰著这片深爱的土地。
电影到此结束，字幕飞快在银幕上划过。
现场所有人都站起来，用力拍著自己的双手，用掌声表达自己对杨靖宇將军的敬意，用掌声表达自己对这部电影的支持。那强烈的掌声如同咆哮著的松江，猛然撞在四周的墙壁上，化作经久不息的回声。
等放映厅的灯亮起来，丁建中跟方致远握了握手，称讚地道：“当初我看到《危急使命》片，就知道这是一部思想性、艺术性、观赏性有机统一的优秀作品！现在看完完整版，发现比我预想的还要好！主旋律电影就应该这么搞！”
出席首映礼的抗联老战士都非常激动，拉著剧组主创的手，激动地表示：“这部电影拍得好，
拍出了抗联的精神！”、“看完这部电影，我们觉得我们的流血牺牲是值得的！”、“这部电影拍得好，真的拍得好！”—
內地主旋律电影，尤其是讲革命先烈的电影，往往比较沉重，甚至比压抑。《危机使命》完全不同，只有电影开头十来分钟比较压抑，整部风格跟后来的《湄公河行动》接近，拍得悬念重重惊险刺激，观眾看完都感觉热血沸腾。
“今年上半年有一部讲述杨靖宇將军的电影《步入辉煌》，那部片子就不怎么看好！《危急使命》好看多了！小分队成员一个比一个厉害，让人想起了《桥》