原先与他一起出生入死的刘香一股势力心有不甘，拉到广东，继续其海上劫掠营生。
在断绝了大明陆地的联繫，刘香势力与荷兰人勾结，在一段时间內对郑芝龙造成很大威胁。
刘香势力在广东崛起后，台湾海峡又转趋不平静。新上任的福建巡抚邹维璉宣布恢復海禁，並力阻郑芝龙与在台湾的荷兰人私下通商。
去年（1632年12月4日），郑芝龙与刘香的船队在福州附近遭遇，发生血战，从早上打到傍晚，双方各死伤郑芝龙800～1000人。
郑芝龙弟弟郑芝虎在身上两处负伤的情况下，冲入敌阵，被刘香的人用四爪锚和铁链缠住，几乎不能脱身，后来是部下拼死救出。刘香本人则向南逃逸而去。
祖泽润在知道这场海上大战之后大喜，认为终於找到了可以牵制郑芝龙的力量，只要刘香在海上围剿郑芝龙，他在陆地上包围郑芝龙在福建的城池，如此两面夹击，胜算极大。
结果却没想到刘香对朝廷的痛恨还在郑芝龙之上，让他的谋划无功而返。
祖府中灯火通明，祖家难得全家匯聚在一起，举办了一场热闹的家宴。
家宴的喧囂渐渐散去，祖大寿、吴襄、吴三桂等一眾將亲友坐在一起。
祖泽润询问：“长伯，你们的长江水师练得怎么样，能不能在海上作战？”
吴襄和吴三桂相互对视了一眼，眼中满是疑惑，他们不清楚祖泽润突然这么问的意图。
吴三桂沉吟片刻，谨慎地说道：“在长江里，咱们的水师还有一战之力。但海上的环境和长江大不相同，风向、浪涛都更为复杂，战力只怕会差一些。”
当初被徐晨放过的那批九边將门，有很大一部分逃到江南，侯恂对这些人委以重任，南明朝廷重组的禁军，大部分都是由这些將门担任主將。
这其中最被他委以重任的则是辽东的將门，祖大寿为左军大都督，是现在南明朝廷的军方第一人，吴襄被侯恂任命为长江水师总官兵，统领的五万水师將士，吴三桂为水师参將，祖泽润为锦衣卫指挥使，次子祖泽薄为兵部郎中。三子祖泽洪为游击將军。
侯恂知自己在江南根基浅薄，江南的士绅选择他做內阁首辅，不过是觉得大同社不会放过他，他没有投降的余地，不会出卖江南。
但侯恂也担心江南的地主士绅为了討好大同社而出卖自己，所以格外重视从北方逃过来的官员和武將，南明朝廷的军权也因此几乎控制在九边將门手中，因为祖大寿和