，但大德，需由朝廷册封任命。
各寺的大德中推举一人，由朝廷授为寺院住持，其中德高望重的大寺的大德住持，可称为方丈，比住持名望高，而其它授封为大德，未担任住持，或是从住持职位上下来的，则是寺院长老。
在住持之下，则是全新的执事僧体系，分工明確，分东序，主负责行政事务，和西序，主负责修行业务。
东序设都寺，总领院务，监寺，庶务管理。副寺，主管財务，维那，监察纪律，典座管炊事，直岁管农事。
而西序设首座，统领僧眾，书记主管文书，知藏管经籍，知客负责接待，知殿负责香火，知沐管沐浴等。
废止三纲，寺院管理权集中於住持，两序分工。
因为住持需由大德才能担任，而大德需由朝廷授封，故此清规的这套制度，其实就是把佛门寺院，也真正纳入朝廷的管理中来。
各寺住持，由两序执事僧和长老们推举，由前任住持推荐，但他必须得是大德，而大德得由朝廷赐封才行。
故此，朝廷才真正掌握各寺住持的人选，而寺中大权，又都归於住持。
除了组织架构的革新，清规还订立了寺院运行机构，比如规定上下均力，僧眾除了要严格遵守戒律，吃斋念经外，还得参与农耕、採薪、挑水等劳作，一日不作，一日不食，过午不食，不食荤腥等等。
农禪並重，寺院自给自足。
此外，重大事务，僧团共议，而违反戒律，也有一套惩戒制度，若是犯了国法，则还要交与官府依法处置。
在这套清规下，还有比较重要的核心条文，比如禁止僧尼蓄积八不净物，禁止寺院借三宝之名放贷收息营利。
《佛门清规》，就是在李逸授意下，有保恭等大德背书的佛门基本法。
从组织架构，到僧人戒律，再到对僧人剃度规定，对財物处置等都有了统一规定。
这些规定，必须遵守。
由於这份清规九卷，是十大德领衔编撰，一百多位大德署名参与，朝廷正式推行，就拥有了极强的约束力。
白马寺，是佛门祖庭，地位崇高，可保恭等十大德，地位却也在慧隱等之上。
当李逸现在掏出清规，还拿出佛教原始戒律，慧隱这位高僧大德上座，也无法反驳。
而按著这旧戒律和新清规，白马寺占有一千六百余顷田地，有著大量没度牒的僧人，还有几千净人为他们做役，更蓄积了许多麦粟和钱绢，而且也在借贷